Portál farmáře Mze je rozcestníkem, respektive vstupní branou ke všem registrům a aplikacím v resortu MZe. Pomocí jednoho přístupového jména Portál farmáře MZe zobrazí všechny systémy, do nichž má daný uživatel přístup.
Portál farmáře SZIF je jedním z těchto systémů. Jeho postavení je na rozdíl od registru LPIS nebu IZR specifické, protože se jedná o samostatný portál, který je primárně určen pro přípravu žádostí o dotace a sledování průběhu administrace. S portálem farmáře MZe je propojen pouze skrze jednotné přihlášení, aby se uživatel při přestupu mezi portály „nemusel opětovně přihlašovat“. Za veškerý obsah a podporu provozu Portálu farmáře SZIF odpovídá platební agentura SZIF.